Программа позволяет выстраивать автоматизированные многодисциплинарные расчеты для решения различных задач. В HEEDS MDO интегрированы средства построения, отладки и запуска расчетных схем, инструменты контроля и анализа результатов расчетов для всех блоков, входящих в расчетную схему. 

Предусмотрены инструменты интеграции не только коммерческого ПО, но и собственных разработок пользователя: запуск исполняемых файлов, расчетов MS EXCEL, скриптов на языке Python.

Для анализа данных предусмотрен постпроцессор, позволяющий проводить анализ истории сходимости задачи, анализировать данные в параллельных координатах, проводить корреляционный анализ и анализ чувствительности целевой функции и ограничений к параметрам.